Institut für Organische Chemie und Chemische Biologie -
Prof. Dr. Michael Göbel

 

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Expertise

  • Die Gruppe von Prof. Göbel befasst sich mit der Synthese von Rezeptormolekülen, die in ihren Wirt-Gast-Komplexen chemische Reaktionen katalysieren. Schwerpunkte liegen auf den Gebieten der stereoselektiven C-C-Verknüpfungen sowie den sequenzspezifischen Nucleinsäurespaltungen. Weitere Themen sind die molekulare Erkennung von Biopolymeren (RNA) sowie die matrizengesteuerte Oligomerisierung von RNA.

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Methoden und Geräte

  • Synthese funktionaler Moleküle.
  • Molekulare Erkennung und Katalyse durch Anionenrezeptoren.
  • Niedermolekulare RNA-Liganden
  • Synthetische Ribonucleasen.
  • DNA-spaltende synthetische Phosphodiesterasen.
  • Matrizengesteuerte Oligomerisierung von RNA.

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Mitarbeiter:

  • Dr. Ute Scheffer

 

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Publikationen

  • Akalay D, Duerner G, Goebel MW: A first case of asymmetric catalysis induced by metal-free bisoxazolines. Eur J Org Chem 2008;: 2365-2368.
  • Schueller A, Suhartono M, Fechner U, Tanrikulu Y, Breitung S, Scheffer U, Goebel MW, Schneider G: The concept of template-based de novo design from drug-derived molecular fragments and its application to TAR RNA. J Comput-Aided Mol Des 2008; 22:59-68.
  • Suhartono M, Weidlich M, Stein T, Karas M, Duerner G, Goebel MW: Synthesis of non-natural aromatic alpha -amino acids by a Heck reaction. Eur J Org Chem 2008;: 1608-1614.
  • Akalay D, Duerner G, Bats JW, Bolte M, Goebel MW: Synthesis of C2-symmetric bisamidines: A new type of chiral metal-free Lewis Acid Analogue interacting with carbonyl groups. J Org Chem 2007; 72:5618-5624.
  • Givehchi A, Ludwig V, Boden O, Krebs A, Scheffer U, Goebel M, Schneider G: Classification and prediction of tripeptides inhibiting HIV-1 Tat/TAR-RNA interaction using a self-organizing map. Lett Drug Des Discovery 2007; 4:410-416.
  • Nandi CK, Parui PP, Brutschy B, Scheffer U, Goebel M: Fluorescence correlation spectroscopy at single molecule level on the Tat-TAR complex and its inhibitors. Biopolymers 2007; 89:17-25.
  • Ludwig V, Krebs A, Stoll M, Dietrich U, Ferner J, Schwalbe H, Scheffer U, Durner G, Gobel MW: Tripeptides from synthetic amino acids block the Tat-TAR association and slow down HIV spread in cell cultures. Chembiochem 2007; 8:1850-1856.
  • Morgner N, Barth HD, Schmidt TL, Heckel A, Scheffer U, Göbel M, Fucini P, Brutschy B: Detecting Specific Ligand Binding to Nucleic Acids: A Test for Ultrasoft Laser Mass Spectrometry. Z Phys Chem 2007; 221:689-704.
  • Tanrikulu Y, Nietert M, Scheffer U, Proschak E, Grabowski K, Schneider P, Weidlich M, Karas M, Goebel M, Schneider G: Scaffold hopping by fuzzy pharmacophores and its application to RNA targets. ChemBioChem 2007; 8:1932-1936.
  • Gnaccarini C, Peter S, Scheffer U, Vonhoff S, Klussmann S, Göbel MW: Site Specific Cleavage of RNA by a Metal Free Artificial Nuclease Attached to Antisense Oligonucleotides. J Am Chem Soc 2006; 128:8063-8067.
  • Renner S, Ludwig V, Boden O, Scheffer U, Göbel MW, Schneider G: New inhibitors of the Tat-TAR RNA interaction found with a fuzzy pharmacophore model. ChemBioChem 2005; 6:1119-1125.
  • Riguet E, Désiré J, Boden O, Ludwig V, Göbel M, Bailly C, Décout J-L: Neamine dimers targeting the HIV-1 TAR RNA. Bioorg Med Chem Lett 2005; 15:4651-4655.
  • Scheffer U, Strick A, Ludwig V, Peter S, Kalden E, Göbel MW: Metal-Free Catalysts for the Hydrolysis of RNA Derived from Guanidines, 2- Aminopyridines, and 2 Aminobenzimidazoles. J Am Chem Soc 2005; 127:2211-2217.
  • Scheffer U, Göbel M: Fluorescence-Based On-Line Detection as an Analytical Tool in RNA Electrophoresis. In Oligonucleotide Synthesis: Methods and Applications.P. Herdewijn, ed., 2004;: 261-272.
  • Hey M, Hartel C, Göbel MW: Nonenzymatic Oligomerization of Ribonucleotides: Towards in vitro Selection Experiments. Helv Chim Acta 2003; 86:844-854.
  • Krebs A, Ludwig V, Boden O, Göbel MW: Targeting the HIV Trans-Activation Responsive Region–Approaches Towards RNA-Binding Drugs. ChemBioChem 2003; 4:972-978.
  • Pitsch S, Scheffer U, Hey M, Strick A, Göbel MW: On Facts and Artefacts: The Difficulty to Evaluate an Artificial Nuclease. Helv Chim Acta 2003; 86:3740-3752.
  • Tsogoeva SB, Dürner G, Bolte M, Göbel MW: C2-Chiral Bis(Amidinium)-Catalyst for a Diels-Alder Reaction Constituting the Key Step of the Quinkert-Dane Estrone Synthesis. Eur J Org Chem 2003;: 1661-1664.

 
   

 

 

INSTITUTE UND MEDIZINISCHE ZENTREN

 
Chemie

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Institut für Organische Chemie und Chemische Biologie

Prof. Dr. Joachim W. Engels

Prof. Dr. Michael Göbel

Prof. Dr. Gisbert Schneider

Pharmazie

Institut für Pharmazeutische Biologie

Prof. Dr. Theo Dingermann

Prof. Dr. Rolf Marschalek

Institut für Pharmazeutische Chemie

Prof. Dr. Michael Karas

Prof. Dr. Manfred Schubert-Zsilavecz

Prof. Dr. Holger Stark

Prof. Dr. Dieter Steinhilber

Institut für Pharmazeutische Technologie

Prof. Dr. Jennifer Dressman

Prof. Dr. Jörg Kreuter

Pharmakologisches Institut für Naturwissenschaftler

Prof. Dr. Jochen Klein

Prof. Dr. Walter E. Müller

Gustav-Embden-Zentrum für Biologische Chemie

Institut für
Biochemie I: Pathobiochemie

Prof. Dr. Bernhard Brüne

Zentrum der Hygiene

Medizinische Virologie

Prof. Dr. Hans Wilhelm Doerr

Dr. Senckenbergische Anatomie

Anatomie I: Klinische Neuroanatomie

Prof. Dr. Thomas Deller

Anatomie II: Experimentelle Neurobiologie

Prof. Dr. Horst-Werner Korf

Zentrum der Pharmakologie

Allgemeine Pharmakologie und Toxikologie

Prof. Dr. Josef Pfeilschifter

Immunpharmakologie

Prof. Dr. Heinfried Radeke

Klinische Pharmakologie

Prof. Dr. Dr. Gerd Geißlinger

Zentrum der Physiologie

Physiologie I: Kardiovaskuläre Physiologie

Prof. Dr. Ralf Brandes

Institute for Vascular Signalling

Prof. Dr. Ingrid Fleming

Zentrum für Gesundheits-
wissenschaften

Allgemeinmedizin

Prof. Dr. Ferdinand Gerlach

Zentrum der Anästhesiologie und Wiederbelebung

Anästhesiologie, Intensivmedizin und Schmerztherapie

Prof. Dr. Oliver Habler

Prof. Dr. Paul Kessler

Zentrum der Chirurgie

Klinik für Allgemeinchirurgie

Prof. Dr. Wolf O. Bechstein

Dr. Christiane Gog

Dr. Christoph W. Strey

PD Dr. Christoph Wullstein

Mund-, Kiefer- und Plastische Gesichtschirurgie

Prof. Dr. Dr. Dr. Robert Sader

Zentrum der Dermatologie und Venerologie

Klinik für Dermatologie, Venerologie und Allergologie

Prof. Dr. Roland Kaufmann

Zentrum der Frauenheilkunde und Geburtshilfe

Klinik für Frauenheilkunde und Geburtshilfe

Prof. Dr. Manfred Kaufmann

Zentrum der Inneren Medizin

Med. Klinik I: Gastroenterologie und Hepatologie, Pneumologie und Allergologie, Endokrinologie und Diabetologie sowie Ernährungsmedizin

Prof. Dr. Christoph Sarrazin

PD Dr. Dr. Oliver Schröder

Prof. Dr. Gerlinde Teuber

Prof. Dr. Stefan Zeuzem

Med. Klinik II: Hämatologie / Onkologie, Rheumatologie, Infektiologie, Therapie der HIV - Erkrankung

Prof. Dr. Harald Burkhardt

Prof. Dr. Hubert Serve

Zentrum für Kinder- und Jugendmedizin

Klinik I: Stoffwechsel, Endokrinologie, Gastroenterologie, Ernährung, Pneumologie, Allergologie, Infektiologie, Neurologie und Neonatologie

Prof. Dr. Hansjosef Böhles

Prof. Dr. Stefan Zielen

Klinik für Pädiatrische Hämatologie, Onkologie und Hämostaseologie

Prof. Dr. Peter Bader

Prof. Dr. Thomas Klingebiel

Dr. Ulrike Köhl

Prof. Dr. Thomas Lehrnbecher

Prof. Dr. Dirk Schwabe

Zentrum der Neurologie und Neurochirurgie

Klinik für Neurologie

Prof. Georg Auburger

Prof. Rüdiger Hilker

Dr. H. Laufs

Dr. Matthias Lorenz

PD Dr. N. Müller

Prof. Dr. T. Neumann-Haefelin

Prof. Dr. Helmuth Steinmetz

Prof. Dr. Ulf Ziemann

Zentrum der Radiologie

Institut für Diagnostische und Interventionelle Radiologie

Prof. Dr. Thomas Vogl

Institut für Neuroradiologie

Prof. Dr. Friedhelm Zanella

Klinik für Nuklearmedizin

Prof. Dr. Frank Grünwald